Pierwszy zbór baptystyczny pojawił się w tym kraju w 1995 roku. Teraz 304 takie zbory tworzą Baptystyczną Unię Kambodży.

Jej priorytetem jest zakładanie nowych zborów. Unia ta planuje założenie przynajmniej jednego zboru w każdym z 1.621 okręgów, składających się ze wspólnot od 5 do 13 wiosek. Każda z 24 prowincji tego kraju będzie miała pięciu dobrze przygotowanych misjonarzy pracujących nad zakładaniem nowych zborów. W tym roku wybrano 62 takich misjonarzy, a sześć rodzin misjonarzy wysłano do sześciu wytypowanych prowincji. Kościół Baptystów w Kambodży w latach 1995-2000 realizował program zakładania nowych zborów, a w latach 2003-2008 program budowania nowych domów modlitwy. Od 2009 roku znowu priorytetem jest praca nad powstawaniem nowych zborów. „Naszym celem jest misja niesienia Dobrej Nowiny dla wszystkich ludzi w 24 prowincjach Kambodży” – mówią tamtejsi baptyści. Ostatnio w konferencji pastorów i misjonarzy uczestniczył Fausto Vasconcelos, dyrektor Misji i Ewangelizacji Światowego Związku Baptystów. Wzięło w niej udział prawie 60 pastorów z 17 prowincji. Tamtejsi baptyści prowadzą szeroko zakrojoną służbę społeczną: pomagają rolnikom, prowadzą dożywianie sierot, realizują program nauki czytania i pisania, przez dystrybucję ryżu walczą z głodem (Baptist World,4/2011).